水稻机械化育秧较人工占有很大优势，是水稻全程机械化的重要部分，对水稻增产增收起很大作用，主要表现在以下几个方面：
1、秧苗强壮、出苗率高。机械育秧可一次性实现放土、播种、盖籽、洒水等流程，速度是手工育秧的10倍以上。基质育秧由于播种均匀，营养土温度调控适宜，出苗时间比传统育秧提早2天左右，并且出苗整齐，出叶速度极快。机械化育出的秧苗的株高降低，叶片宽而长，白根多，成秧率高，秧苗期限比传统育秧短4天左右。
2、盘根强，易于机械化操作。基质的重量较轻，方便运输。基质育秧均匀性好，盘根强，栽秧后发根快，发苗快。可加快栽插速度，并减少插秧时的空穴率。
3、减少病虫害。机械化基质育秧使得秧苗生长速度快，15天左右就可以达到移栽的标准。这样就可以避开一些病虫害的侵害，有效将病虫害隔离于田地之外。另外基质育秧也可以有效避免传统育秧时营养土中草种的草害的发生。
4、技术简单，失败风险小。机械化育秧技术是流水操作，不仅减少了人工环节而且风险小，成本支出小，容易被农民所接受。
5、不受天气影响，栽插速度快。机械化育秧的秧苗的栽插缺穴率小，即使碰到阴雨天，基质秧块也可以迅速排掉水分，不影响栽插的速度和质量。
6、节约成本，增加产量。机械化基质育秧可节约成本，由于育苗期农药用量低或不用农药，使得育出的秧苗素质高，种植后长势好，促进产量增加。
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