6月22日-23日，农业部赴福建抗洪救灾工作督导组赶赴受灾最重的南平和三明两市，实地察看受灾农田、设施农业和畜牧养殖场现场，慰问受灾农民和基层干部群众，共同研究提出灾后恢复生产意见和措施，重点抓好五项工作：一是加强分类指导。根据不同地区、不同产业、不同作物苗情、不同生产进度和农民的不同需求，组织专家和技术人员深入乡村田间地头，进一步摸清受灾具体情况，因地制宜制定灾后恢复生产方案，进行分类指导。二是强化田管措施。安排农机动力和人力及时到位，指导农民清沟排洪排涝，尽快恢复作物生长。及时指导扶苗洗苗，培土增肥，采取根外追肥等措施，切实加强田间管理，最大限度减轻灾害损失。三是及时改种补种。加强技术指导，采取改种、补种、补救措施。对绝收田块及时改种晚稻、蔬菜、玉米；对受灾的甘薯、蔬菜等农作物，及时组织补种。四是加强病虫害防控。暴雨洪涝过后，容易诱发稻飞虱、纹枯病、稻瘟病等病虫害的流行蔓延。要切实加强预测预报，落实防控措施，组织专业化统防统治，严防病虫害暴发。五是做好消毒灭源工作。抓紧对死亡牲畜进行无害化处理，对畜禽养殖场和周围环境进行彻底消毒，落实消毒责任制，消除疫情隐患，确保大灾之后无大疫。
据悉，福建省委、省政府高度重视防汛抗洪救灾工作，省农业厅认真落实各项防灾抗灾救灾工作，努力减轻灾害损失。一是及时周密部署。先后以明电下发《关于切实做好防御强降雨工作的紧急通知》和《关于进一步做好防御强降雨工作的紧急通知》，要求各级农业（畜牧兽医）部门务必加强工作组织领导，确保思想、人员、物资、责任、措施“五到位”，最大限度地减轻灾害损失。二是加强应急值守。及时启动农业自然灾害应急预案，实行24小时应急值班制度，实行灾情日报制度，收集、汇总灾情损失，确保信息畅通。三是加强抗灾救灾工作指导。先后派出以厅领导带队的4个救灾工作组和2个救灾专家服务队，分赴三明、南平、龙岩等受灾地区，指导灾区做好农业抗灾救灾和灾后恢复生产工作。四是及时调拨救灾物资。为确保大灾之后无大疫，已向南平、三明、龙岩下拨消毒剂34吨。为帮助农民加快灾后生产恢复，已下拨水稻应急种子7.3万公斤。