尽管沈阳市农业机械化有了长足发展，取得了显著成效。但是距离农业现代化的要求还有相当大的差距，存在着不少问题。

 一是农机装备结构不合理。从沈阳市目前农机装备结构现状看，拖拉机多，水田插秧机械和水稻、玉米收获机械少。在拖拉机中，小型拖拉机多，大中型拖拉机少，传统作业机械多，高性能复式作业机械少。在机具的种类配置上存在着极大的不平衡。

 二是对农机化的投入力度仍显不足。近几年，尽管国家、省、市农机补贴力度不断加大，但仍满足不了广大农民的实际需求。仅从沈阳市的农机购置补贴实际来看，今年能够享受农机补贴的农户仅占报名总数的三分之一。同时，作为农机投资主体的农民自我积累能力弱，农机产品价位较高，作业成本逐年增加，农机作业季节性强、投资回收期长、利润不高，制约了农民对高性能农机的投入。

 三是农机专业合作社管理需进一步加强。近年来，通过政策引导，加大扶持，我市有农机专业合作社发展速度较快，但组织管理松散、不紧密，作业规模、作业水平、管理水平还较低，需尽快上规模、上档次、上水平。

 四是大机械与小地块矛盾突出。农村实行联产承包责任制后，一家一户小块经营给广大农民提供了一定的“生活保险”和“就业保险”，广大农民形成了因循守旧、安于现状的思想。随着国家不断加大惠农政策力度，农民“惜地、恋地”情结日益严重，一家一户小块经营的现状短时间内很难扭转，大机械无法充分发挥其作用、收益不高，严重制约了农机合作社的发展步伐。

 五是组织管理力量薄弱。市农机部门原是独立的工作机构，近30人，现在只有6个人，各乡镇目前没有农机管理机构，只有一个农机兼职管理人员，农机新技术推广和农机管理相当薄弱。